薛宝平¹ , 张昊¹ , 祖欢欢 ¹ , 姬俏华¹ , 林金辉¹ , 党峰峰 ¹ , 王延峰^1,,2*

1 延安大学生命科学学院, 延安, 716000; 2 陕西省红枣重点实验室, 延安, 716000; 3 福建农林大学作物学院, 福州, 350000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16 卷, 第 8 篇   
收稿日期: 2017年11月23日    接受日期: 2017年12月07日    发表日期: 2018年08月07日

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推荐引用：

引用格式：Xue B.P., Zhang H., Zu H.H., Ji Q.H., Lin J.H., Dang F.F., and Wang Y.F., 2018, Bioinformatics analysis of the WRKY transcription factor family in Ziziphus jujuba, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 16(14): 4543-4558 (薛宝平, 张昊, 祖欢欢, 姬俏华, 林金辉, 党峰峰, 王延峰, 2018, 枣 WRKY 转录因子家族的生物信息学分析, 分子植物育种, 16(14): 4543-4558)

明确枣 WRKY 转录因子家族生物学特征，为深入研究枣 WRKY 家族基因的功能提供科学依据。通过 DNAMAN6、MEGA5、Mapdarw 和 MEME Suite 4.12.0 等软件对枣 WRKY 转录因子的数目、基因分类、染色体定位、系统进化关系和保守基序进行了分析。结果表明：枣中包含 92 个 WRKY 基因，根据 WRKY 结构域数量及其锌指结构的特征可将其分为 Group 玉、Group 域和 Group 芋，Group 域又可分为域 a、域 b、域 c、域 d和域 e 5 个亚组。枣 12 条假染色体上除了第 7 条染色体上没有查到枣 WRKY 基因分布外，其它 11 条染色体都有 WRKY 基因分布，其中第 11 条染色体上分布最多，有 10 个 WRKY 基因，第 2 条、第 5 条和第 8 条染色体分布最少，仅有 2 个 WRKY 基因。枣芋、域 d 和域 e 处在同一分支，玉、域 a、域 b 和域 c 在同一分支。枣 WRKY转录因子在同一类或亚类中含有相同的保守 Motif，Motif 最长为 50，最短为 21。枣 WRKY 转录因子蛋白在67~758 个氨基酸范围之间，平均氨基酸个数为 384，等电点为 4.130 8~10.221 1 不等。本研究对进一步探究枣
WRKY 基因的功能、进化以及分子育种具有重要的现实意义。

枣；WRKY；转录因子； 生物信息学